רק 10 שנים לאחר מהומות סטונוול שהתחילו את תנועת השחרור ההומואים, מגיפת האיידס פגעה בארה"ב בשנים 1981-1994, יותר מ-400,000 אנשים אובחנו עם HIV/איידס. מכיוון שהנגיף השפיע באופן לא פרופורציונלי על קהילת הלהט"ב, רבים מניצולי סטונוול אבדו, יחד עם היסטוריה ממקור ראשון של המהומות ההיסטוריות.